表观遗传学研究的利器--illumina850K芯片

 DNA 甲基化在基因表达调控中扮演着重要的角色，参与生物体多种重要的生命活动。此外，DNA 甲基化异常及其对基因表达的影响会导致人类的许多复杂疾病的发生，如癌症、神经疾病和糖尿病等。

Ø850k 芯片简介

   为了研究甲基化在人体内的重要作用， 加速甲基化研究的临床进展，Illumina 推出了高通量的450k 甲基化芯片，并取得巨大成功。 在此基础上， Illumina 推出了新一代的升级版甲基化芯片Infinium MethylationEPIC BeadChip（简称850k 芯片），为研究者提供了一个更经济可靠的甲基化研究平台。可广泛应用于干细胞研究、肿瘤和其他复杂疾病研究，是更适合于表观基因组全关联分析研究（EWAS）的一款芯片。

Ø850k 芯片覆盖位点
n涵盖 Infinium Methylation 450 BeadChip 芯片
中 90%以上的位点
nCpG 岛以外的 CpG 位点
n人类干细胞中的非 CpG 甲基化位点（CHH 位点）
n正常组织与肿瘤（多种癌症）组织差异甲基化位点
nFANTOM5 增强子
nENCODE 开放染色质和增强子
n脱氧核糖核酸酶超敏位点
nmiRNA 启动子区域

Ø850k 芯片优势
全面的基因组覆盖范围： 检测>850,000 个 CpG 位点， 全面覆盖 CpG 岛、启动子、编码区及增强子。
高质量的数据： 沿用了 450k 芯片的 Infinium 技术，同时采用 InfiniumI 及 II 探针设计， 使检测范围最大化。
分辨率高： 单碱基分辨率，可以直接检测到发生甲基化的准确位点。
可重复性高： 自身技术重复间的相关性以及与 450K 相同探针间的相关性R2 > 0.98。
起始模板量低： 仅需 250ng， 大大节约了样品量。
适用于 FFPE