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荔园转录组平台——表达谱芯片服务

美国Affymetrix公司是基因芯片产业先行者，早在1989年就研制出了世界首张基因芯片。其开发的寡核苷酸原位光刻合成专利技术(light-controlled in situ synthesis of DNA microarrays)，是目前最高密度的芯片制备技术。人类基因表达谱芯片（PrimeView Human Gene Expression Array）提供了最高质量的工业级表达谱技术，实现了全面的全基因组表达分析。PrimeView具有极强的信号值，并且在生物学重复之间具有相关性，致使PrimeView成为了药物和疾病研究的强大的研究工具。

华联芯片：

Affymetrix芯片：

表达谱芯片服务实例

信号值分布曲线图展示了所有芯片探针的表达值分布统计情况。横坐标表示探针表达值区间，纵坐标表示在表达值区间内探针统计量；图例位于柱状图的左上方；每一曲线代表一张芯片在不同表达值区间的探针个数统计量。信号值分布曲线的重合度越好表示芯片实验的可靠性越高。该项目所有芯片结果都非常可靠。

聚类图展示了所有样本和差异基因在表达值层面的聚集情况。红色表示基因的信号值相对上调。绿色表示基因的信号值相对下调，黑色表示基因的信号值适中，灰色表示基因的信号值未检出；图例位于聚类图的左上方；上部树状结构是根据所有样本的信号值对所有样本进行层次聚类获得的树状结构，左侧树状结构是根据所有的差异基因的信号值对所有基因进行层次聚类获得树状结构。在树状结构中相邻的两个样本或者基因表示具有更高的相似性。

基因网络图展示了差异基因在组织或者细胞中基因与基因之间的信号传递过程，为分子机制研究提供了可能的信号传递路径。绿色代表基因芯片下调基因:圆点大小和实验组中基因表达差异相关，圆点越大，实验组和对照组中的表达差异越大；红色代表基因芯片上调基因:圆点大小和实验组中基因表达差异相关，圆点越大，实验组和对照组中的表达差异越大；灰色代表系统添加的关联基因。