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基因组平台



     

     荔园基因组平台——全基因组重测序



        一、服务介绍


       全基因组重测序是对基因组序列已知物种的个体进行基因组测序,并在个体或群体水平进行差异性分析的方法。基 

       于全基因组重测序技术,我们能够快速的进行种子资源普查筛选,寻找到大量基因变异,并实现遗传进化分析及重

       要性状候选基因预测。而随着测序成本降低和已知基因组序列的物种增多,重测序已成为动植物育种研究中最为迅

       速有效的方法之一。


       二、操作流程


       提取基因组DNA并随机打断,电泳回收所需长度的DNA片段,并加上接头进行Cluster制备,最后上机测序。利用

       双末端(Paired-End) 的方案对插入片段两端进行测序,除获得序列信息外,还有利于大片段结构变异的挖掘。


        三、指标评价


       测序深度是评价测序量的最重要指标,测序深度的增加有利于基因组覆盖度的上升,并同时减少测序的错误率。在

       重测序个体水平采用双末端测序,当测序深度在10X以上时,基因组覆盖度和测序错误率控制均得以保证。而在群

       体方面,3-5X即可得到保证。