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蛋白组平台


荔园蛋白组平台——SILAC



SILAC介绍


SILAC即细胞培养条件下稳定同位素标记技术(Stable isotope labeling with amino acids in cell culture,SILAC),其基本原理是分别采用含有轻、中或重型同位素必需氨基酸的培养基培养细胞(用于SILAC的稳定同位素氨基酸主要有Lys和Arg),新合成的蛋白质即嵌合了同位素氨基酸,如此培养5-6代后,细胞的所有蛋白质均被同位素标记上。经处理因素刺激后,等量混合各类型蛋白质,然后经SDS-PAGE分离和质谱分析,通过比较一级质谱图中同位素峰型的面积大小进行相对定量,同时二级谱图对肽段进行序列测定从而鉴定蛋白质。

由于SILAC标记技术是体内标记技术,几乎不影响细胞的功能,同时灵敏度高,因此其在蛋白质组学相关领域中得到了广泛的应用,如比较蛋白质组学,蛋白质与蛋白质相互作用,蛋白质与DNA相互作用,蛋白质与RNA相互作用等领域。

SILAC技术的适用范围主要包括:定量蛋白质组分析,蛋白质实时表达动态研究,分子标志物鉴定等。研究领域涉及:多种生物学、医学的基础研究以及药物研发等方向。

荔园基因的SILAC服务可以实现细胞、动物水平的同位素标记,检测准确,实验重复性好。相对于荔园基因的iTRAQ服务,由于SILAC采用了体内同位素标记技术,其标记效率更高,定量更准确,是定量蛋白质组研究的首选。


技术原理


标记:在缺乏Lys和Arg的培养基中添加Lys和Arg的同位素培养细胞,使蛋白质被标记成“重型”; 
细胞处理,如药物处理等;
细胞裂解、提取蛋白质;
等量混合对照与处理组蛋白质、SDS-PAGE电泳、染色;
割取蛋白质条带,胰蛋白酶消化,质谱分析;
生物信息学分析。