荔园蛋白组平台——iTRAQ
iTRAQ介绍
iTRAQ （Isobaric tag for relative and absolute quantitation，iTRAQ）定量蛋白质组学是蛋白酶切后形成多肽，用iTRAQ同位素试剂标记多肽N末端或赖氨酸侧链基团。标记后的肽段经过液相分离，进行一级质谱和二级质谱分析，在二级质谱前，被标记的不同样本中的同一肽段表现为相同的质荷比和其他理化性质。而在二级质谱中，信号离子表现为不同质荷比(114～121)的峰，根据波峰的高度及面积，可以鉴定出蛋白质和分析出同一蛋白质不同处理的定量信息。
iTRAQ技术的适用范围主要包括：定量蛋白质组分析，蛋白质实时表达动态研究，分子标志物鉴定等。研究领域涉及：多种生物学、医学的基础研究以及药物研发等方向。
荔园基因的iTRAQ服务实现了全自动化操作，仅需105的细胞即可检出6000个蛋白。相对于荔园基因的SILAC服务，iTRAQ适用于多种样品类型（包括组织样本、血样、尿样等），最多可同时标记8个样品，成本较SILAC低。
技术原理
该技术利用同位素标签标记多肽末端氨基或赖氨酸侧链氨基基团，经高分辨质谱仪串联分析，可同时比较多达8种样品之间的蛋白质表达量。
待测蛋白质的氨基酸N端及赖氨酸侧链氨基与iTRAQ试剂连接，被同位素标记；
在一级质谱图中，任何一种iTRAQ试剂标记不同样本中的同一蛋白质表现为相同的质荷比；
在一级质谱中，不同来源的相同肽段表现为一个峰；
在二级质谱中，iTRAQ试剂中的平衡基团发生中性丢失，信号离子表现为不同质荷比(114-121)的峰，因此根据波峰的高度及面积，可以得到同一蛋白在不同样本中的表达差异；
肽段的MS/MS结果结合数据库检索可以鉴定出相应的蛋白种类。
实验流程
参考文献
Fang P, Ying H, et al. Dissecting characteristics and dynamics of differentially expressed proteins during multistage carcinogenesis of human colorectal cancer. World J Gastroenterol. 2016. (IF=2.8).
Cheng DD, Yu T, et al. MiR-542-5p is a negative prognostic factor and promotes osteosarcoma tumorigenesis by targeting HUWE1. Oncotarget. 2016. (IF=5.0)
Chiung HH, Chia WH, et al. Identification and characterization of potential biomarkers by quantitative tissue proteomics of primary lung adenocarcinoma. Mol Cell Proteomics. 2016. (IF=5.9).
Mertins P, Mani DR, et al. Proteogenomics connects somatic mutations to signalling in breast cancer. Nature. 2016. (IF=38.1)
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