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分子平台


荔园分子平台——甲基化检测



实验原理


DNA甲基化存在于大多数真核生物中,一般发生在CpG双核苷酸中胞嘧啶的5’UTR区,起调控作用。CpG的胞嘧啶大概有80%被甲基化,20%处于基因调控区的CpG岛中。BSP甲基化测序(Bisulfite Genomic Sequencing PCR)的原理通过对基因组DNA进行重亚硫酸盐处理,非甲基化的胞嘧啶被脱氨基而转变成尿嘧啶,在随后的PCR反应中尿嘧啶转变成胸腺嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不能被脱氨基,在反应完成时被保留(见下图),我们将扩增得到的PCR产物进行TA克隆测序,就可以分析甲基化发生的具体情况。该方法实验结果准确性高,是甲基化检测的金标准。


实验流程



实验结果实例

图1 三样本的甲基化结果圈点图分析

  注:图中有三个样本,每个样本含5个克隆测序结果,共计15个测序结果。每个圆圈代表一个CG位点,黑圈代表甲基化,白圈代表未甲基化;每一行代表一个样本TA克隆的一个测序结果,序列中所有的CG位点情况可被被罗列,此例序列中共含有31个CG位点。