荔园非编码RNA平台——miRNA芯片
miRNA芯片介绍
大多数人认为，癌症是因为基因表达混乱而造成的。据统计，超过30%的编码基因的转录可以被miRNA调控；同 时也有大量的证据显示，在信号网路中miRNA可以与lncRNA相互作用，来调控可变剪接的发生，比如它可以影 响细胞凋亡，细胞增殖和细胞分化等。吉凯基因提供的miRNA表达谱芯（GeneChip miRNA 4.0 Array）可以同 时检测人，小鼠，大鼠等203个物种的miNRA，100% 覆盖mirBase v20数据库，包含了30424个成熟的miRNA。 miRNA芯片可以对关键节点miRNA差异的准确检测，成为了解密基因表达上下游关系起到了重要的作用，为生理 和发育研究miRNA的作用提供一个强有力的工具。
实验结果实例
信号值分布曲线图展示了所有芯片探针的表达值分布统计情况。横坐标表示探针表达值区间，纵坐标表示在表 达值区间内探针统计量；图例位于柱状图的左上方；每一曲线代表一张芯片在不同表达值区间的探针个数统计 量。信号值分布曲线的重合度越好表示芯片实验的可靠性越高。该项目所有芯片结果都非常可靠。
聚类图展示了所有样本和差异基因在表达值层面的聚集情况。红色表示基因的信号值相对上调。绿色表示基因 的信号值相对下调，黑色表示基因的信号值适中，灰色表示基因的信号值未检出；图例位于聚类图的左上方； 上部树状结构是根据所有样本的信号值对所有样本进行层次聚类获得的树状结构，左侧树状结构是根据所有的 差异基因的信号值对所有基因进行层次聚类获得树状结构。在树状结构中相邻的两个样本或者基因表示具有更 高的相似性。
根据筛选出的差异倍数最大的10 个microRNA，在Targetscan，microRNA.ORG和miRDBA三个数据库中对进行 microRNA进行靶基因预测。根据靶基因预测的结果，获得三个数据库中共有的靶基因，进行Pathway分析。根 据KEGG与BIOCARTA中所有pathway的基因信息，将靶基因进行富集分析，根据P值排序后，我们选取前十位的加 以展示。
荔园基因
购物车