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非编码RNA平台


荔园非编码RNA平台——miRNA病毒包装



实验原理


miRNA是在真核生物中发现的具有调控功能的内源性非编码RNA,大小约20~25个核苷酸。我们根据成熟miRNA序列信息,合成含有茎环结构的前体miRNA连接至含侧翼序列的表达载体中(见图6.1),将其转染/病毒包装感染进入细胞后,由II型启动子(CMV)启动表达,经核酸酶的剪切加工,组装RNA诱导的沉默复合体,通过碱基互补配对的方式识别靶mRNA,并根据互补程度的不同指导沉默复合体降解靶mRNA或者阻遏靶mRNA的翻译。


图1 miRNA表达载体示意图



技术应用


通过过表达miRNA研究其功能并进行靶点筛选的后期研究工作


实验流程




实验结果实例


图1 miRNA 慢病毒包装实验结果 

A:miRNA 慢病毒表达载体测序结果;B:miRNA 慢病毒感染 293 细胞照片。




TROUBLESHOOTING


实验问题

原因

推荐解决方法

miRNA过表达质粒构建过程中未能筛选到阳性克隆?

试剂问题

注意OIigo片段的纯化级别、退火buffer、连接酶体系、感受态细胞的效率等。

miRNA过表达质粒测序失败?

发夹结构影响测序

更换技术能力更好的测序公司。

miRNA过表达质粒对细胞转染效率低?

转染条件不佳

采用适合该细胞的转染试剂,优化转染条件。

细胞本身难转染

采用病毒介导miRNA的过表达。



常见问题FAQ


Q :为什么选择贵公司进行miRNA的表达载体构建工作?

A :我们提供miRNA表达载体构建,可以在每一步操作为您把关:Oligo片段经PAGE纯化,质量优良,保证无碱基突变的情况;在载体构建以及测序验证过程中操作经验丰富,可以快速为您构建好所需的miRNA表达载体。


Q :什么是miRNA mimics, miRNA inhibitor?其应用有哪些?

A :miRNA mimics:运用化学合成的方法,模拟生物体内源的miRNA,特异性增强内源型miRNA的功能。

miRNA inhibitor:化学修饰的专门针对细胞中特异的靶miRNA的抑制剂,可特异高效的抑制生物体内源性miRNA的活性。

以上化学合成片段获取方便快捷,短时间内可以转染细胞,增加或抑制miRNA的活性,检测miRNA所调节的基因表达和对信号通路的影响,对阐明miRNA在诸如细胞发育、增值、分化和凋亡中的机理有重要意义。


Q :miRNA表达载体相对化学合成的miRNA mimics的优势有哪些?

A :miRNA表达载体相对化学合成miRNA可以进行质粒扩增、抽提,转染细胞或包装慢病毒感染细胞后,表达时长高于miRNA mimics,并且后续可以进行稳转株的构建工作;另外miRNA表达载体含GFP荧光标记,表达荧光更加稳定,方便进行转染或感染后的示踪。



参考文献


1. Ambros V.MicroR NAs: Tiny R egulators with Great Potential. Cell 2001;107(7):823-826.

2. Ambros V.The functions of animal micro R NAs.Nature 2004;431(7006):350-355.

3. Bartel DP.MicroR NAs:genomics,biogenesis, mechanism, and function.Cell 2004;116(2):281-297.